La unidad de Climatología desarrolla las siguientes líneas de investigación:
- Variabilidad climática interestacional, interanual y multidecadal.
- Predicción climática estacional.
- Interacción océano-atmósfera.
- Ondas y oscilaciones oceánicas y atmosféricas tropicales.
- Cambio climático de escala regional a global.
- Mecanismos de teleconexión.
- Modelado océano-atmósfera global.
- Reconstrucciones paleoclimáticas e históricas de El Niño.